RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619831.4

DMD-229, Transcript of dystrophin, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 13,734 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-229	ENST00000619831	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PMPCB	O75439	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FKBP9	O95302	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SLC5A3	P53794	718 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TAB1	Q15750	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CLOCK	O15516	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CHEK2	O96017	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RFX3	P48380	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CLCN2	P51788	898 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AMPD2	Q01433	879 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	BTN3A3	O00478	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CENPA	P49450	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	LPIN1	Q14693	890 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AOC3	Q16853	763 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	OMD	Q99983	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TSPAN4	O14817	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TGM2	P21980	687 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	RCN3	Q96D15	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TPP1	O14773	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZBTB5	O15062	677 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NPTXR	O95502	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	NCK1	P16333	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HMOX2	P30519	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CYP4F8	P98187	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AXIN1	O15169	862 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	JAK1	P23458	1154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SLC16A1	P53985	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831		E5RI56	91 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	CDH3	P22223	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DMD-229	ENST00000619831	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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