RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJC1P36383 396 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VIPR2P41587 438 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUBP50607 506 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEUP1Q05D60 604 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RFFLQ8WZ73 363 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF34Q969K3 372 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM50BQ9Y247 325 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DESP17661 470 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBX4P57082 545 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF5AQ12840 1032 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MESDQ14696 234 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC14Q49A88 953 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WBP2Q969T9 261 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERPINB11Q96P15 392 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INTUQ9ULD6 942 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LEFTY2O00292 366 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRAK2O43187 625 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRM2Q14416 872 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM131BQ86XD5 332 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIN3Q8TB24 985 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMARCD2Q92925 531 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASB16Q96NS5 453 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPY6RQ99463 290 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGVQ9NUD9 493 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TDP1Q9NUW8 608 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GDE1Q9NZC3 331 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR2E1Q9Y466 385 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOCS3O95396 460 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OLFM2O95897 454 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAMP2P13473 410 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNNT1P13805 278 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GBP1P32455 592 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GGCXP38435 758 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC7A9P82251 487 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZXDBP98169 803 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AAK1Q2M2I8 961 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PARM1Q6UWI2 310 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNPY3Q9BT09 278 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYO1FO00160 1098 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms