RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 INPP5DQ92835 1189 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLC5A5Q92911 643 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 EME1Q96AY2 570 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM136AQ96C01 138 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 POLE3Q9NRF9 147 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RRN3Q9NYV6 651 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NCAM2O15394 837 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ITGA9Q13797 1035 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CEP78Q5JTW2 689 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 APOL2Q9BQE5 337 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TRIM66O15016 1216 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 AKAP3O75969 853 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 OR1E1P30953 314 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RRM2P31350 389 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 THTPAQ9BU02 230 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ASB7Q9H672 318 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 27.7
TNS1-221ENST00000615025 MICAL2O94851 1124 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RARRES1P49788 294 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MAPK7Q13164 816 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZNF544Q6NX49 715 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MTSS1LQ765P7 747 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MSRAQ9UJ68 235 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM86B1E9PN63 330 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MSCO60682 206 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RAMP2O60895 175 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 LGALS2P05162 132 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PYGMP11217 842 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MAPK9P45984 424 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PKN1Q16512 942 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MARC1Q5VT66 337 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 IYDQ6PHW0 289 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SERPINB11Q96P15 392 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SERPINB12Q96P63 405 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 V9GYQ6 96 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLIT1O75093 1534 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ACKR2O00590 384 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SPTLC1O15269 473 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PROSCO94903 275 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FYNP06241 537 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FUT11Q495W5 492 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TATDN2Q93075 761 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ADAM2Q99965 735 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SLITRK3O94933 977 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 BMP10O95393 424 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 WLSQ5T9L3 541 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TTI2Q6NXR4 508 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.25□□□□□ -0.615e-10■■■■■ 124.2
TNS1-221ENST00000615025 ZNF614Q8N883 585 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ERP27Q96DN0 273 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 THAP11Q96EK4 314 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 SPG21Q9NZD8 308 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MAP10Q9P2G4 905 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 NFASCO94856 1347 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 PGS1Q32NB8 556 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 INTS13Q9NVM9 706 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 15.2
TNS1-221ENST00000615025 DDR1Q08345 913 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-221ENST00000615025 ILDR2Q71H61 639 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms