RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MT-CO1	P00395	513 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	INHA	P05111	366 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PAEP	P09466	180 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CPB1	P15086	417 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VEGFB	P49765	207 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ITIH3	Q06033	890 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RMI1	Q9H9A7	625 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MCF2L	O15068	1137 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	BEST1	O76090	585 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CHN1	P15882	459 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC1A1	P43005	524 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ACLY	P53396	1101 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SESN3	P58005	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CHRNA1	P02708	482 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ANO4	Q32M45	955 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0G2JND7	137 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0U1RQS6	177 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CES2	O00748	559 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TH	P07101	528 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GRK4	P32298	578 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SULT1E1	P49888	294 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	QPCT	Q16769	361 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC39C	Q8N584	583 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	APOL5	Q9BWW9	433 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MTA2	O94776	668 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGB1	P05556	798 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RBL1	P28749	1068 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CPA2	P48052	419 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GBE1	Q04446	702 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RCN2	Q14257	317 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CNGA2	Q16280	664 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SV2C	Q496J9	727 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	UBR7	Q8N806	425 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC2	Q96KP1	924 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PLK2	Q9NYY3	685 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DERA	Q9Y315	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.18	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms