RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594216.1

RAB11B-202, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11B, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-202ENST00000594216 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.09■□□□□ 0.17
RAB11B-202ENST00000594216 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RAB11B-202ENST00000594216 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 KLKB1P03952 638 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CHKAP35790 457 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PPP2R5DQ14738 602 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FBXO43Q4G163 708 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 C12orf40Q86WS4 652 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DENND1CQ8IV53 801 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NAT16Q8N8M0 369 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PNKPQ96T60 521 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 BBS2Q9BXC9 721 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.08■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 RNF40O75150 1001 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ERBB2P04626 1255 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FYNP06241 537 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MMEP08473 750 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PLA2G5P39877 138 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SLC6A11P48066 632 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CCR3P51677 355 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ARID5AQ03989 594 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 KDSRQ06136 332 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 GAS6Q14393 721 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NFKBIBQ15653 356 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 BEND5Q7L4P6 421 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF677Q86XU0 584 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 BHMTQ93088 406 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.07■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 A0A1B0GTH6 734 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FAM170AA1A519 330 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 KAT7O95251 611 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SP9P0CG40 484 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TYRP14679 529 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CXCL12P48061 93 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CDR2Q01850 454 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TAF5Q15542 800 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ERICH1Q86X53 443 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ADAM32Q8TC27 787 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SERPINB11Q96P15 392 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MARK1Q9P0L2 795 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DEC1Q9P2X7 70 aa16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 HSF2BPO75031 334 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ATG13O75143 517 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TULP3O75386 442 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 APODP05090 189 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 GLI1P08151 1106 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 GRIA2P42262 883 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SEC13P55735 322 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TBX4P57082 545 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 SATB1Q01826 763 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DCAF6Q58WW2 860 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NAA35Q5VZE5 725 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TSSK4Q6SA08 328 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 TAC4Q86UU9 113 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 PLK2Q9NYY3 685 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB11B-202ENST00000594216 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms