RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	COMT	P21964	271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PSMA2	P25787	234 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	IL1R2	P27930	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SDC4	P31431	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLC1A1	P43005	524 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TAS2R40	P59535	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLC7A9	P82251	487 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NNT	Q13423	1086 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MESD	Q14696	234 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TEAD2	Q15562	447 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934		M0QYT0	321 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF197	O14709	1029 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CAPN9	O14815	690 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MIP	P30301	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SULT1E1	P49888	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PEX5	P50542	639 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ATP11A	P98196	1134 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	WBP2	Q969T9	261 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	WDR24	Q96S15	920 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CLUH	O75153	1309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	F9	P00740	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FOSL2	P15408	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	HDC	P19113	662 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RING1	Q06587	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DAAM2	Q86T65	1068 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FTCD	O95954	541 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KLKB1	P03952	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TCF3	P15923	654 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FSHR	P23945	695 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CTNNA2	P26232	953 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ARSE	P51690	589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	KCNQ1	P51787	676 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SCAP	Q12770	1279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CDO1	Q16878	200 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-204	ENST00000589934	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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