RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SASH3O75995 380 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ADRA1BP35368 520 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR15P49685 360 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPP19P56211 112 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ROR1Q01973 937 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 EDEM1Q92611 657 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CRISPLD1Q9H336 500 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 WHRNQ9P202 907 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX24Q9Y343 169 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR27A2RRH5 827 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 APOL1O14791 398 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM12O43184 909 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 IVDP26440 423 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRC2P26717 231 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PPM1AP35813 382 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GLUD2P49448 558 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NME3Q13232 169 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NOMO1Q15155 1222 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF365Q70YC5 407 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.387e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TAC4Q86UU9 113 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PLD5Q8N7P1 536 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 BADQ92934 168 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 YME1L1Q96TA2 773 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 AAASQ9NRG9 546 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DDIT4Q9NX09 232 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 GJB5O95377 273 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM153BP0C7A2 387 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNLT1P63172 113 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM153CQ494X1 144 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 EFHC2Q5JST6 749 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TPGS2Q68CL5 300 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC89Q8N998 374 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ART4Q93070 314 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC114Q96M63 670 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.65■■□□□ 1.38
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CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 NMUR1Q9HB89 426 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BRJ5 948 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 ABLIM3O94929 683 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT14P02533 472 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 ITIH2P19823 946 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 YWHAQP27348 245 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1D2P34982 312 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 HCAR3P49019 387 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP4Q13115 394 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA3BQ13214 749 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM240Q5SV17 173 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 HAUS1Q96CS2 278 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQH9 124 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 IRAK2O43187 625 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00271P0C7V0 271 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL4AP40617 200 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 PSEN1P49768 467 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 USP46P62068 366 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-207ENST00000589146 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.63■■□□□ 1.37
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