RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 PIF1Q9H611 641 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 RAB21Q9UL25 225 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 CRTAMO95727 393 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ELK3P41970 407 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 MYBPC2Q14324 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 GDF3Q9NR23 364 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 GPR182O15218 404 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 LRG1P02750 347 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 TCF3P15923 654 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM24O15164 1050 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 WDR27A2RRH5 827 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 BAIAP3O94812 1187 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TRAF2Q12933 501 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 RAD54BQ9Y620 910 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 TBCELQ5QJ74 424 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 FGFR2P21802 821 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 MIEF2Q96C03 454 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 DIP2AQ14689 1571 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 SNTNA6NMZ2 147 aa21.89■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 WDR48Q8TAF3 677 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 TKTL1P51854 596 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 POU1F1P28069 291 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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