RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446	SLC7A9	P82251	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	OGDH	Q02218	1023 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TFF2	Q03403	129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RNF34	Q969K3	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MYADM	Q96S97	322 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TBCB	Q99426	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NPY6R	Q99463	290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	IRAK2	O43187	625 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	BUB1	O43683	1085 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RNF8	O76064	485 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	F9	P00740	461 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	APOE	P02649	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TBX4	P57082	545 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	COG7	P83436	770 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NNT	Q13423	1086 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MESD	Q14696	234 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.11	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PROSC	O94903	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC2A3	P11169	496 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LAMP2	P13473	410 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CCR1	P32246	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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