RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ADCY6	O43306	1168 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	IL4R	P24394	825 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	MCL1	Q07820	350 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	DCAF6	Q58WW2	860 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CFAP157	Q5JU67	520 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	GABBR2	O75899	941 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ATG7	O95352	703 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RIPK1	Q13546	671 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	KCTD2	Q14681	263 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	IER5	Q5VY09	327 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ILDR2	Q71H61	639 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	DCLK2	Q8N568	766 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ACKR2	O00590	384 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	TCEA3	O75764	348 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ABHD2	P08910	425 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	METTL7B	Q6UX53	244 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	APOPT1	Q96IL0	206 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	USP29	Q9HBJ7	922 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	NUP205	Q92621	2012 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	MCM3AP	O60318	1980 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001		A6NJR5	290 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	C2CD2L	O14523	706 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CDK16	Q00536	496 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RDM1	Q8NG50	284 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	MZB1	Q8WU39	189 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF39	Q9H2S5	420 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CSAD	Q9Y600	493 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	MED7	O43513	233 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC22	O60826	627 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CILP	O75339	1184 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	AMH	P03971	560 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ITGA9	Q13797	1035 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CRYM	Q14894	314 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	AGAP2	Q99490	1192 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ZFAT	Q9P243	1243 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ABLIM1	O14639	778 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	TPP1	O14773	563 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SERPINB6	P35237	376 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ALAD	P13716	330 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	GNAZ	P19086	355 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	NXN	Q6DKJ4	435 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	EDEM1	Q92611	657 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RSAD1	Q9HA92	442 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	KRT37	O76014	449 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PSMB4	P28070	264 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	HDAC4	P56524	1084 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	STX3	Q13277	289 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF460	Q14592	562 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	NOMO1	Q15155	1222 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PID1	Q7Z2X4	250 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PCGF5	Q86SE9	256 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	UBR7	Q8N806	425 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	GJD2	Q9UKL4	321 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	HMX2	A2RU54	273 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PSMG1	O95456	288 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	PROC	P04070	461 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
PRPF8-216	ENST00000577001	SERPINB5	P36952	375 aa		15.3	■□□□□ 0.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms