RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL13BQ3SXY8 428 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf228Q6PIY5 440 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPNTQ6UXI9 565 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCAMP5Q8TAC9 235 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSPG4P5Q96PW8 444 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM204AQ9H8W3 233 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC13Q9NSE7 274 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNB1P01574 187 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCAPQ12770 1279 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP128Q6ZU80 1094 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLIS1Q8NBF1 620 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDEM1Q92611 657 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 VWCEQ96DN2 955 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTPALQ9BTX7 342 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDIT4Q9NX09 232 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP350Q5VT06 3117 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BRJ5 948 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D4O60343 1298 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMP1P01033 207 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRA1BP35368 520 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NR2C2P49116 596 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPS1Q13098 491 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCGF5Q86SE9 256 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKNOX2Q96KN3 472 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXW11Q9UKB1 542 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP69A5D8W1 941 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA8KD6RF30 607 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR17Q13304 367 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NECAB2Q7Z6G3 386 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRUNE1Q86TP1 453 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUP93Q8N1F7 819 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPPL2BQ8TCT7 592 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOP1MTQ969P6 601 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXO44Q9H4M3 255 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CWH43Q9H720 699 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 H7C0C1 242 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFCAB14O75071 495 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ETS1P14921 441 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPB1P15086 417 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP5OP48047 213 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTP2Q5QGT7 225 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTBD8Q5XKL5 378 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB9Q96C00 473 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GALT6Q96L58 329 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM51Q9NW97 253 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEY1Q9Y5J3 304 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO16Q9Y6X6 1858 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF40O75150 1001 aa30.2■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GOT1P17174 413 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PBX3P40426 434 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXCR3P49682 368 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 XRCC4Q13426 336 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC45BQ8IWX7 931 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 PYROXD2Q8N2H3 581 aa30.2■■■□□ 2.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAM32Q8TC27 787 aa30.2■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0355O15063 1070 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 GDF10P55107 478 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MORF4L2Q15014 288 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SCML2Q9UQR0 700 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 NFS1Q9Y697 457 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PLXNA3P51805 1871 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARPP19P56211 112 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP41Q3LFD5 358 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAC4Q86UU9 113 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC25Q86WR0 208 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM106CQ9BVX2 250 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf88Q9H8K7 445 aa30.18■■■□□ 2.42
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