RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	IRAK2	O43187	625 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	PI15	O43692	258 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CYP17A1	P05093	508 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	IRF1	P10914	325 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CHRNB1	P11230	501 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CD72	P21854	359 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ZXDB	P98169	803 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CCIN	Q13939	588 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	PON2	Q15165	354 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	FIGN	Q5HY92	759 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CPXM2	Q8N436	756 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	C18orf8	Q96DM3	657 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	PNKP	Q96T60	521 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	DEC1	Q9P2X7	70 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	MYH10	P35580	1976 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	APOD	P05090	189 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	DES	P17661	470 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	GRIA2	P42262	883 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	CDK17	Q00537	523 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ANGPT1	Q15389	498 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ANO4	Q32M45	955 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150		Q6ZNB5	142 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ARC	Q7LC44	396 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PKD1-238	ENST00000570150	GFPT2	O94808	682 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	F9	P00740	461 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	APOE	P02649	317 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TNFRSF4	P43489	277 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	GABRB2	P47870	512 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CXCL12	P48061	93 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SOX9	P48436	509 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PGF	P49763	221 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MRE11	P49959	708 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	GALK1	P51570	392 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	UBASH3A	P57075	661 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLC6A3	Q01959	620 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TTC8	Q8TAM2	541 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	EDEM1	Q92611	657 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150		A0A0A0MRY4	1105 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NPC1	O15118	1278 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CACNG3	O60359	315 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	HOXA6	P31267	233 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TBX4	P57082	545 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NR1I3	Q14994	352 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	PASD1	Q8IV76	773 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	CPXM1	Q96SM3	734 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	ACP6	Q9NPH0	428 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	SHISA7	A6NL88	538 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	GREM1	O60565	184 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FANCC	Q00597	558 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	FZD5	Q13467	585 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PKD1-238	ENST00000570150	VPS36	Q86VN1	386 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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