RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DENND1CQ8IV53 801 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NOX5Q96PH1 765 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MARK1Q9P0L2 795 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CEP83Q9Y592 693 aa22.01■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 K7ESF4 209 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CYBBP04839 570 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NCAM1P13591 858 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 UCHL3P15374 230 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PTMSP20962 102 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CLCN1P35523 988 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TNFRSF4P43489 277 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 FNTBP49356 437 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SNX16P57768 344 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 GRAMD4Q6IC98 578 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SLC47A2Q86VL8 602 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PASD1Q8IV76 773 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 E5RJQ4 531 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CAPN9O14815 690 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 HOXA6P31267 233 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PDCLQ13371 301 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SYT13Q7L8C5 426 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM110Q86TL2 294 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LONP2Q86WA8 852 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 USP33Q8TEY7 942 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 BHMTQ93088 406 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 STK33Q9BYT3 514 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LHX5Q9H2C1 402 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PIEZO1Q92508 2521 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 A0A0A0MRY4 1105 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SMTNL1A8MU46 457 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CACNG3O60359 315 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LILRB5O75023 590 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DMC1Q14565 340 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TIE1P35590 1138 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 UBXN1Q04323 297 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DMWDQ09019 674 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 MESP2Q0VG99 397 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CPXM2Q8N436 756 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TERB1Q8NA31 727 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SYNCQ9H7C4 482 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PLK2Q9NYY3 685 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 RAB23Q9ULC3 237 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.97■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LGALS16A8MUM7 142 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 F8VZ95 297 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 LATS1O95835 1130 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF18P17022 549 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CNR2P34972 360 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DGKGP49619 791 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 KLK7P49862 253 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TBX4P57082 545 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NCAPHQ15003 741 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 BEND5Q7L4P6 421 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 NEK11Q8NG66 645 aa21.96■■□□□ 1.11
SNAP23-216ENST00000568331 DDI1Q8WTU0 396 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms