RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2A3Q93084 1043 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECT2Q9H8V3 914 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.093e-13■■■■■ 28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERPING1P05155 500 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPM1P09493 284 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAC4Q86UU9 113 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK25O00506 426 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKCQQ04759 706 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 Q6ZNB5 142 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 MON1BQ7L1V2 547 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPA6Q8N4T0 437 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLCNQ8NFG4 579 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLD4Q96BZ4 506 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 F5P12259 2224 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHISA7A6NL88 538 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAB1O75553 588 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFATC1O95644 943 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 STARD6P59095 220 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND1CQ8IV53 801 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHDQ96IW2 340 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERPINB11Q96P15 392 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC7Q99615 494 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR37L1O60883 481 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFAP3LO75121 409 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP17A1P05093 508 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALB1P05937 261 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCNN1AP37088 669 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX4P57082 545 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK17Q00537 523 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHCR24Q15392 516 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR59Q6PJI9 974 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTUB2Q96DC9 234 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCLK3Q9C098 648 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJB6O95452 261 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGLV3-27P01718 113 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLULP15104 373 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTHP32929 405 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOS2P35228 1153 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 MATKP42679 507 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHFRQ96EP1 664 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXQ1Q9C009 403 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 COX16Q9P0S2 106 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGLV3-25P01717 112 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJA4P35212 333 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLT3P36888 993 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR1H3Q13133 447 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID5BQ14865 1188 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRNP1Q6NT89 227 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM25Q86YD3 366 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM3CQ92520 227 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDIT4Q9NX09 232 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms