RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564547.1

TRAPPC2L-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC2L, Length 980 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-208ENST00000564547 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KCNK3O14649 394 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 YEATS4O95619 227 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NR3C1P04150 777 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HLA-EP13747 358 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CD58P19256 250 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PRKCHP24723 683 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GCLMP48507 274 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 COPAP53621 1224 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LAYNQ6UX15 382 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF366Q8N895 744 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MDM1Q8TC05 714 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TNIP3Q96KP6 325 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ARID3AQ99856 593 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 COMMD8Q9NX08 183 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CLSTN1O94985 981 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FAM200BP0CF97 657 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 AMPD3Q01432 767 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 INCA1Q0VD86 236 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ENPP2Q13822 863 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF394Q53GI3 561 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PROSER1Q86XN7 944 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CEP76Q8TAP6 659 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CRELD1Q96HD1 420 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MTG2Q9H4K7 406 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NAGPAQ9UK23 515 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 USP3Q9Y6I4 520 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KALRNO60229 2985 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1W2PQD8 194 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GABBR2O75899 941 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CD6P30203 668 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HOXD12P35452 270 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TPMTP51580 245 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SGSHP51688 502 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EFEMP1Q12805 493 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CEP135Q66GS9 1140 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FAM124AQ86V42 546 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NAXDQ8IW45 347 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ATP8B3O60423 1300 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MYH10P35580 1976 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1B0GVL5 298 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CILPO75339 1184 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KIF20AO95235 890 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CALCAP01258 141 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 NCAM1P13591 858 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PLA2G4AP47712 749 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CLDN6P56747 220 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF234Q14588 700 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 UNC93AQ86WB7 457 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DENND1CQ8IV53 801 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms