RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561637.5

NME3-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-202ENST00000561637 BHMTQ93088 406 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TMEM9BQ9NQ34 198 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DNMT3LQ9UJW3 386 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 MMP17Q9ULZ9 603 aa26.56■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 STC2O76061 302 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 CEACAM1P13688 526 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 GRIA2P42262 883 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PI4KAP42356 2102 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 EFEMP1Q12805 493 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ANO7Q6IWH7 933 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 Q6ZNB5 142 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TSTD1Q8NFU3 115 aa26.55■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 O00370 1275 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ADAM23O75077 832 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BCKDHBP21953 392 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TKTL1P51854 596 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 IRX4P78413 519 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PAK1Q13153 545 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 SGO2Q562F6 1265 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 NT5C1BQ96P26 610 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 MED15Q96RN5 788 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DSPP15924 2871 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 NBEAQ8NFP9 2946 aa26.54■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 GABBR2O75899 941 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ACAP1Q15027 740 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 CRY1Q16526 586 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TMEM270Q6UE05 265 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 RRAGAQ7L523 313 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DEFB124Q8NES8 71 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 MDGA1Q8NFP4 955 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ERLEC1Q96DZ1 483 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PLK2Q9NYY3 685 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa26.53■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 A0A0A0MRY4 1105 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TMEM8BA6NDV4 472 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 RALAP11233 206 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 TYRP14679 529 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PPP1R2P41236 205 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PLA2G4AP47712 749 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BCAT1P54687 386 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 ADIGQ0VDE8 80 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 GON4LQ3T8J9 2241 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BBS2Q9BXC9 721 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 DEC1Q9P2X7 70 aa26.52■■□□□ 1.84
NME3-202ENST00000561637 BICDL2A1A5D9 508 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PIK3R2O00459 728 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 VDRP11473 427 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 WASP42768 502 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PSEN1P49768 467 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 RGS7P49802 495 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PKDCCQ504Y2 493 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 RASSF3Q86WH2 238 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 TERB1Q8NA31 727 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PMM2O15305 246 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 ZBED1O96006 694 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 TNFRSF4P43489 277 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 UBE2HP62256 183 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 RING1Q06587 406 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 KCNH2Q12809 1159 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 GRAMD4Q6IC98 578 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME3-202ENST00000561637 ACOX2Q99424 681 aa26.5■■□□□ 1.83
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