RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-208ENST00000560725 XDHP47989 1333 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-208ENST00000560725 NSD2O96028 1365 aa6.71□□□□□ -1.33
TMOD3-208ENST00000560725 FLT4P35916 1363 aa6.71□□□□□ -1.33
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0B4J269 797 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GVC2 190 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 MARCH11A6NNE9 402 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 F5H697 171 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF623O75123 536 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 FAM155BO75949 473 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 PGDP52209 483 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 BCAT1P54687 386 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 FPGSQ05932 587 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TUBB3Q13509 450 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 CCNIQ14094 377 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TTC30AQ86WT1 665 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 NAXEQ8NCW5 288 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 BOD1Q96IK1 185 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 LTN1O94822 1766 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 AGR2O95994 175 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 SRGNP10124 158 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 RBL1P28749 1068 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 EPHA3P29320 983 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TXKP42681 527 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 CYP2A13Q16696 494 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 PPM1MQ96MI6 270 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 BTAF1O14981 1849 aa6.69□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 MYOM1P52179 1685 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 HMX3A6NHT5 357 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 AHRRA9YTQ3 701 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SNX2O60749 519 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ANXA6P08133 673 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ADD2P35612 726 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 MTHFSP49914 203 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 PNLIPRP1P54315 467 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 C1QTNF8P60827 252 aa6.69□□□□□ -1.34
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TMOD3-208ENST00000560725 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 FAM136AQ96C01 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 INTS13Q9NVM9 706 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-208ENST00000560725 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.69□□□□□ -1.34
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