RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTL10Q7L3V2 364 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 BEND5Q7L4P6 421 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITIH5Q86UX2 942 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF34Q969K3 372 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIGVQ9NUD9 493 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPP7Q9UHL4 492 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXNA3P51805 1871 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GREB1Q4ZG55 1949 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC188H7C350 402 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 F9P00740 461 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRG1P02750 347 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8AP07357 584 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT10P13645 584 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP7D3Q8IWC1 876 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC185Q8N715 623 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEKT4Q8WW24 435 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT12Q99456 494 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLE6Q9H808 572 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSER1Q9NX31 292 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP4E1Q9UPM8 1137 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHD9Q3L8U1 2897 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM92AA1XBS5 289 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MDM4O15151 490 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD48P09326 243 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSEN1P49768 467 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC70Q6NSX1 233 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 BNIPLQ7Z465 357 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAC4Q86UU9 113 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELMOD1Q8N336 334 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHOXF2Q9BQY4 288 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR2E1Q9Y466 385 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASB3Q9Y575 518 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAMA3Q16787 3333 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFXAPO00287 272 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PER2O15055 1255 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RARGP13631 454 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDKN2BP42772 138 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDK2Q15119 407 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSC1Q92574 1164 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 HERPUD2Q9BSE4 406 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDCPQ9H6R7 721 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FZD10Q9ULW2 581 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TJP3O95049 919 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELF2Q15723 593 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA9Q16790 459 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFX6Q8HWS3 928 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CASP10Q92851 521 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMG2Q969U7 264 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPC1Q9H2F5 836 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPCAMP16422 314 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRIP1P48552 1158 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMRN1Q13201 1228 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP2R5EQ16537 467 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFHC2Q5JST6 749 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf74Q6P047 294 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.9■□□□□ 0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 OVCA2Q8WZ82 227 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms