RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB6CQ53S08 254 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 NPNTQ6UXI9 565 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 MDM1Q8TC05 714 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 NPY6RQ99463 290 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.89■■□□□ 1.1
TPTEP1-205ENST00000558085 CENPFP49454 3210 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 INPPL1O15357 1258 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 KCNJ11Q14654 390 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC38Q502W7 563 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 EFHC2Q5JST6 749 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SCML4Q8N228 414 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MAML1Q92585 1016 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ACBD6Q9BR61 282 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RGS18Q9NS28 235 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TMEM51Q9NW97 253 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.89■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 H3BRJ5 948 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 KCNN4O15554 427 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ATP2C2O75185 946 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GCATO75600 419 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SCNN1GP51170 649 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CA9Q16790 459 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB41Q5JT25 222 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM35AQ86V20 835 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PALM2Q8IXS6 379 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CNPY4Q8N129 248 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MCUQ8NE86 351 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 IRGQQ8WZA9 623 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 LRRC39Q96DD0 335 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SGSM3Q96HU1 749 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 KRT82Q9NSB4 513 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MIOSQ9NXC5 875 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RAD54BQ9Y620 910 aa21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TMEM120BA0PK00 339 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 KIAA0754O94854 1291 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GSTA2P09210 222 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 COL6A1P12109 1028 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 BRAFP15056 766 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 GJA8P48165 433 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TKTL1P51854 596 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 NTAN1Q96AB6 310 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TOX2Q96NM4 488 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 AP1G2O75843 785 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 F9P00740 461 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TUSC3Q13454 348 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 DCAF6Q58WW2 860 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 LPPQ93052 612 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.099e-9■□□□□ 8.8
TPTEP1-205ENST00000558085 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RASA4BC9J798 803 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RASA4O43374 803 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 DRD4P21917 467 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RBL1P28749 1068 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 MAP3K7CLP57077 242 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CORO7P57737 925 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 DAOAP59103 153 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 VSTM1Q6UX27 236 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 TRABD2AQ86V40 505 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.86■■□□□ 1.09
TPTEP1-205ENST00000558085 USP3Q9Y6I4 520 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms