RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-218	ENST00000557695	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TPP1	O14773	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SPTLC2	O15270	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	INPPL1	O15357	1258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MARCH6	O60337	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	ATG13	O75143	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PLAU	P00749	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	P2RX3	P56373	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	GALE	Q14376	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	AGPS	O00116	658 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FYB1	O15117	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MYF5	P13349	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TACR3	P29371	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	GPC5	P78333	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FMO1	Q01740	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	KEAP1	Q14145	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	CNGA2	Q16280	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	APIP	Q96GX9	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	GOLIM4	O00461	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	POLD2	P49005	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM193A	P78312	1265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PPAT	Q06203	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	GRID2	O43424	1007 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	BRAF	P15056	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	RHCE	P18577	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	HILS1	P60008	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD1-218	ENST00000557695	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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