RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KRT7	P08729	469 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SLC2A3	P11169	496 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HDC	P19113	662 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	IGFBP4	P22692	258 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CXCR3	P49682	368 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PEX5	P50542	639 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HDAC4	P56524	1084 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TAS2R40	P59535	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	EFEMP1	Q12805	493 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TMC8	Q8IU68	726 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RNF34	Q969K3	372 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SERPINB11	Q96P15	392 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	NACA2	Q9H009	215 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	EYS	Q5T1H1	3165 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SLC12A8	A0AV02	714 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DLL1	O00548	723 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COCH	O43405	550 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RHO	P08100	348 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PFKL	P17858	780 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	IL1R2	P27930	398 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CCR1	P32246	355 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ADRA1B	P35368	520 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RWDD2B	P57060	319 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TBX4	P57082	545 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COG7	P83436	770 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	NNT	Q13423	1086 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TUBB2A	Q13885	445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TAC4	Q86UU9	113 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	FAM131B	Q86XD5	332 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PBK	Q96KB5	322 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1W2PRU2	124 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KCNK3	O14649	394 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	MDM4	O15151	490 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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