RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NOS2P35228 1153 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CASP6P55212 293 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PLD4Q96BZ4 506 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DPH5Q9H2P9 285 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RGS18Q9NS28 235 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CD207Q9UJ71 328 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CYP11B1P15538 503 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 WEE1P30291 646 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 OR1E1P30953 314 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 EPHB4P54760 987 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KRT222Q8N1A0 295 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CYLDQ9NQC7 956 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MGEA5O60502 916 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NFICP08651 508 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM253P0C7T8 217 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PFKLP17858 780 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 OXTRP30559 389 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KAZALD1Q96I82 304 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PQY0 241 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KRT87PA6NCN2 255 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PSMC6P62333 389 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NNTQ13423 1086 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM60Q495X7 471 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 APPL1Q9UKG1 709 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 LACTBL1A8MY62 500 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PCSK2P16519 638 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NPR3P17342 541 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TNNI3P19429 210 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC185Q8N715 623 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HASPINQ8TF76 798 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FOXJ1Q92949 421 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MFAP3LO75121 409 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RARGP13631 454 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CHRM3P20309 590 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GPD2P43304 727 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TTI2Q6NXR4 508 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 EID3Q8N140 333 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KRT78Q8N1N4 520 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CYTH2Q99418 400 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FTH1P02794 183 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MYBP10242 640 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 AKAP5P24588 427 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NR2C2P49116 596 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KRT72Q14CN4 511 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 STX19Q8N4C7 294 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 OXR1Q8N573 874 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RUBCNQ92622 972 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 EXT2Q93063 718 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CISHQ9NSE2 258 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CDC23Q9UJX2 597 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KRT14P02533 472 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFS1P28331 727 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TYK2P29597 1187 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEA9P43362 315 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANTXR2P58335 489 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RBBP7Q16576 425 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms