RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PCDH15Q96QU1 1955 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CACNA1EQ15878 2313 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 AKAP13Q12802 2813 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SH3BP5O60239 455 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SLFN14P0C7P3 912 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CD6P30203 668 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 STARD3Q14849 445 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 Q6ZNB5 142 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 BACH2Q9BYV9 841 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 FBXO10Q9UK96 956 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 STC2O76061 302 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 F13A1P00488 732 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 RALAP11233 206 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CD58P19256 250 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PSEN1P49768 467 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 VAMP7P51809 220 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 KIF11P52732 1056 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 INCA1Q0VD86 236 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SLC14A1Q13336 389 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 FUT11Q495W5 492 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 C1orf220Q5T0J3 134 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 RASAL2Q9UJF2 1139 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZZEF1O43149 2961 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SPEGQ15772 3267 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 FAM221BA6H8Z2 402 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 MEI4A8MW99 385 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 HMBSP08397 361 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CHKAP35790 457 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 GCLMP48507 274 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CCDC186Q7Z3E2 898 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SCD5Q86SK9 330 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 UCMAQ8WVF2 138 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 P2RY11Q96G91 374 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CFAP45Q9UL16 551 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 GJB3O75712 270 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 KLKB1P03952 638 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TRIM49P0CI25 452 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TRIM49CP0CI26 452 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 NCAM1P13591 858 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 IL12RB1P42701 662 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 MFAP3P55082 362 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 COG7P83436 770 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 RING1Q06587 406 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 EFEMP1Q12805 493 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 GRIK2Q13002 908 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 GEN1Q17RS7 908 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF394Q53GI3 561 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 FYB2Q5VWT5 728 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ATL3Q6DD88 541 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF276Q8N554 614 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TAS1R2Q8TE23 839 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 GPR174Q9BXC1 333 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 DUSP16Q9BY84 665 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 DCLK3Q9C098 648 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 LHX6Q9UPM6 363 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 USP3Q9Y6I4 520 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GTW7 788 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 NPC1O15118 1278 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CILPO75339 1184 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 PENKP01210 267 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CYBBP04839 570 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 KRT13P13646 458 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF132P52740 706 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 LRSAM1Q6UWE0 723 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 NAXDQ8IW45 347 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-214ENST00000548849 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms