RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RASSF3Q86WH2 238 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DENND1CQ8IV53 801 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TERB1Q8NA31 727 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 NETO1Q8TDF5 533 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RNF139Q8WU17 664 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 HMGB4Q8WW32 186 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DCLK3Q9C098 648 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PLK2Q9NYY3 685 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.45□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PIK3R2O00459 728 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TRIM24O15164 1050 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 GDF9O60383 454 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 GREM1O60565 184 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KLKB1P03952 638 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CYBBP04839 570 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PAEPP09466 180 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ZNF806P0C7X5 589 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KRT5P13647 590 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 WASP42768 502 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DGKGP49619 791 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 LIMK1P53667 647 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CNGA2Q16280 664 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CHPFQ8IZ52 775 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DDI1Q8WTU0 396 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RLN3Q8WXF3 142 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TFAP2BQ92481 460 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 EDEM1Q92611 657 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CKAP5Q14008 2032 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 E7ENQ6 273 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 M0QYV0 167 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 O00370 1275 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TM4SF5O14894 197 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CACNG3O60359 315 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ADAM23O75077 832 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CAVIN2O95810 425 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CALCAP01258 141 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SETSIPP0DME0 302 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 HOXB2P14652 356 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 NTSR1P30989 418 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 MPLP40238 635 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RGS7P49802 495 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 STILQ15468 1287 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 IL31Q6EBC2 164 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZNB5 142 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 C11orf74Q86VG3 221 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 LMO3Q8TAP4 145 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 GOLGA1Q92805 767 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 KAT5Q92993 513 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SPACA7Q96KW9 195 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 MARK1Q9P0L2 795 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 PRRT4C9JH25 899 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 CISD3P0C7P0 127 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-222ENST00000540445 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms