RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	MATN2	O00339	956 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CHL1	O00533	1208 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	FKBP9	O95302	570 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CFB	P00751	764 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GNAT1	P11488	350 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PDE6A	P16499	860 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	FGFR2	P21802	821 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CA8	P35219	290 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CCR3	P51677	355 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	HTR4	Q13639	388 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	NXN	Q6DKJ4	435 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC103	Q8IW40	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	MMP21	Q8N119	569 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CPXCR1	Q8N123	301 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	NXPE1	Q8N323	547 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF276	Q8N554	614 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	C7orf31	Q8N865	590 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	KAT2B	Q92831	832 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	APBB2	Q92870	758 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ALG1	Q9BT22	464 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	VTA1	Q9NP79	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CABP5	Q9NP86	173 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GPR27	Q9NS67	375 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	IL16	Q14005	1332 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	RAD50	Q92878	1312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	NID2	Q14112	1375 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PDZD2	O15018	2839 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	WDR81	Q562E7	1941 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	F5	P12259	2224 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ANHX	E9PGG2	379 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007		M0R2C6	588 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ULK1	O75385	1050 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PRKD3	O94806	890 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ABLIM3	O94929	683 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CAVIN2	O95810	425 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	IL18BP	O95998	194 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	C1R	P00736	705 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	MYL1	P05976	194 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PHKA1	P46020	1223 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CXCL12	P48061	93 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	LSS	P48449	732 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	IL2	P60568	153 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CXADR	P78310	365 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	OCRL	Q01968	901 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	DSG1	Q02413	1049 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CREB5	Q02930	508 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	MAPK7	Q13164	816 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	MLC1	Q15049	377 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	PCOLCE	Q15113	449 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRPL48-208	ENST00000537007	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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