RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557		E9PAM4	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TNNC2	P02585	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	OXTR	P30559	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CTSK	P43235	329 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	GRK6	P43250	576 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	MYL6	P60660	151 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF234	Q14588	700 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FYB2	Q5VWT5	728 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	BIRC7	Q96CA5	298 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FAM163B	P0C2L3	166 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	KRT10	P13645	584 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	JUP	P14923	745 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TLE3	Q04726	772 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ORC1	Q13415	861 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	RTP5	Q14D33	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SNX19	Q92543	992 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	IGSF8	Q969P0	613 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	EBF2	Q9HAK2	575 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	HHLA1	C9JL84	531 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TSPAN3	O60637	253 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	STC2	O76061	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	WNT1	P04628	370 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC130	P13994	396 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	GAP43	P17677	238 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	STARD3	Q14849	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	WDR49	Q8IV35	697 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF366	Q8N895	744 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	NACA2	Q9H009	215 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087X0B3	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GTQ1	180 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ENC1	O14682	589 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	WNT9A	O14904	365 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CYP26A1	O43174	497 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	AP1G2	O75843	785 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	C7	P10643	843 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	GRIA4	P48058	902 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ACADVL	P49748	655 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CCT8	P50990	548 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	HES3	Q5TGS1	186 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SCD5	Q86SK9	330 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ACOT1	Q86TX2	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ERICH1	Q86X53	443 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TSC1	Q92574	1164 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	MED10	Q9BTT4	135 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	KRT82	Q9NSB4	513 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PQH9	124 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	TGFB1I1	O43294	461 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	BRINP1	O60477	761 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV4-34	P06331	123 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	EPHX1	P07099	455 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-222	ENST00000533557	IDE	P14735	1019 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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