RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 BEND5Q7L4P6 421 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 LAMTOR5O43504 91 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 GLI1P08151 1106 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 MMEP08473 750 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CHKAP35790 457 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 UBASH3AP57075 661 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CDR2Q01850 454 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 TCF15Q12870 199 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 NR1I3Q14994 352 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ANGPT1Q15389 498 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINB11Q96P15 392 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ERICH1Q86X53 443 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 MYO6Q9UM54 1294 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 H0Y858 1186 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 EGFP01133 1207 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 GAB4Q2WGN9 574 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRK-222ENST00000532751 NNTQ13423 1086 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRK-222ENST00000532751 NAA35Q5VZE5 725 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRK-222ENST00000532751 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRK-222ENST00000532751 DEC1Q9P2X7 70 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 ATG13O75143 517 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 TYRP14679 529 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF445P59923 1031 aa22.87■■□□□ 1.25
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