RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 OLFM4Q6UX06 510 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC186Q7Z3E2 898 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM140Q9NV12 185 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR2W5A6NFC9 320 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNM1LO00429 736 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 REC8O95072 547 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF20AO95235 890 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 GNAI2P04899 355 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FERP16591 822 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SAT1P21673 171 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 AVPR2P30518 371 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 MCM7P33993 719 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 RABIFP47224 123 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP1A4Q13733 1029 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 C16orf87Q6PH81 154 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLEC17AQ6ZS10 378 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPATA20Q8TB22 786 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF480Q8WV37 535 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ASB11Q8WXH4 323 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR10A5Q9H207 317 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.88□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 A0A1W2PRV1 198 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF785A8K8V0 405 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 HEXBP07686 556 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRKCIP41743 596 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 CPA2P48052 419 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 STARD6P59095 220 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 EGR3Q06889 387 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 RCN2Q14257 317 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SFRP1Q8N474 314 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 DPP10Q8N608 796 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBXO30Q8TB52 745 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 BICD1Q96G01 975 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 KLHL41O60662 606 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 URODP06132 367 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 INHBAP08476 426 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 HTD2P86397 168 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 MVKQ03426 396 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCNMA1Q12791 1236 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 HFEQ30201 348 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP37Q86T82 979 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP76Q8TAP6 659 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTPALQ9BTX7 342 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCND2Q9NZV8 630 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.87□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.86□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 RIPK2O43353 540 aa5.86□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 IFNB1P01574 187 aa5.86□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 GAAP10253 952 aa5.86□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTKP33981 857 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms