RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MYL2P10916 166 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ARSHQ5FYA8 562 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ARMC5Q96C12 935 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CLIP3Q96DZ5 547 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 S100A14Q9HCY8 104 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SIPA1L1O43166 1804 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQY0 241 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 E5RJQ4 531 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN2O75325 713 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CIB2O75838 187 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PMLP29590 882 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SOX5P35711 763 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TGFBIQ15582 683 aa10.47□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF398Q8TD17 642 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SNX27Q96L92 541 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TTC25Q96NG3 672 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 APOL6Q9BWW8 343 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GPR88Q9GZN0 384 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC19Q9H756 370 aa10.47□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 PPME1Q9Y570 386 aa10.47□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLITRK3O94933 977 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RSPH10BP0C881 870 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 KRT72Q14CN4 511 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TMPRSS6Q8IU80 811 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC77Q9BR77 488 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 HIPK3Q9H422 1215 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ATP8B3O60423 1300 aa10.46□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD62A6NC57 917 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ATF2P15336 505 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD13P35453 343 aa10.46□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRPV1Q8NER1 839 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT8Q92599 483 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35C1Q96A29 364 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.46□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 NDC80O14777 642 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 RGS20O76081 388 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PLS3P13797 630 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA13P27216 316 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEA4P43358 317 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CCL23P55773 120 aa10.46□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 CLUL1Q15846 466 aa10.46□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF410Q86VK4 478 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CD101Q93033 1021 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB6Q9BUF5 446 aa10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 AP1G1O43747 822 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EDIL3O43854 480 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 KIZQ2M2Z5 673 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MYH11P35749 1972 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 EMSYQ7Z589 1322 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 CLIC2O15247 247 aa10.45□□□□□ -0.74
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