RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 MARCH6O60337 910 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SGPL1O95470 568 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 HRGP04196 525 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 USP14P54578 494 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CXADRP78310 365 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GABPAQ06546 454 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GRM3Q14832 879 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PDPRQ8NCN5 879 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 L1RE1Q9UN81 338 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MYADML2A6NDP7 307 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 E9PLN8 166 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CDKL5O76039 1030 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD16AO95870 558 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GH2P01242 217 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 C6P13671 934 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MAPK4P31152 587 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MCM7P33993 719 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SOX8P57073 446 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GUCY1B3Q02153 619 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 TCF15Q12870 199 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DGKHQ86XP1 1220 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 Q8NA96 180 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RNF31Q96EP0 1072 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ADAM2Q99965 735 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 STAP2Q9UGK3 403 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GJD2Q9UKL4 321 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 DOCK1Q14185 1865 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 A6NNZ2 444 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 GOLIM4O00461 696 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-225ENST00000515835 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 KCNA2P16389 499 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SHMT1P34896 483 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PLCD1P51178 756 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CCNA1P78396 465 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZXDAP98168 799 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD18Q0P651 414 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CYP2A13Q16696 494 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 USP37Q86T82 979 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N1X5 172 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SMOQ99835 787 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 SWAP70Q9UH65 585 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 BRCA2P51587 3418 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PPL8 197 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PS29 197 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 HDCP19113 662 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 ADD2P35612 726 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 PTPAQ15257 358 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-225ENST00000515835 LLGL1Q15334 1064 aa7.1□□□□□ -1.27
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