RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 SLC11A2P49281 568 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 UCP3P55916 312 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 WNT3P56703 355 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 RAB1AP62820 205 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CYP4F2P78329 520 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CXCL9Q07325 125 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SLC39A6Q13433 755 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 NEK8Q86SG6 692 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 FANCBQ8NB91 859 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 GLG1Q92896 1179 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 DPH1Q9BZG8 443 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SLX4Q8IY92 1834 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PROB1E7EW31 1015 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 OFD1O75665 1012 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 ALDH1L1O75891 902 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 KELP23276 732 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CERS1P27544 350 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SREBF2Q12772 1141 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 MYO1EQ12965 1108 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 E2F2Q14209 437 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC157Q569K6 752 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CEP78Q5JTW2 689 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PCID2Q5JVF3 399 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 LAYNQ6UX15 382 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB123Q8N688 67 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-217ENST00000509355 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 ARMT1Q9H993 441 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 QSOX1O00391 747 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 PPP6CO00743 305 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 CYP2C9P11712 490 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.52e-10■■■□□ 14.6
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PDE4D-217ENST00000509355 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-217ENST00000509355 FGL2Q14314 439 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZWC4 215 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 ERO1AQ96HE7 468 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-217ENST00000509355 GLOD4Q9HC38 313 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-217ENST00000509355 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-217ENST00000509355 TUBB4AP04350 444 aa5.64□□□□□ -1.51
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PDE4D-217ENST00000509355 TM4SF4P48230 202 aa5.64□□□□□ -1.51
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PDE4D-217ENST00000509355 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 MORN5Q5VZ52 161 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 CHSY1Q86X52 802 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 CDCA5Q96FF9 252 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-217ENST00000509355 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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