RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CNGA4Q8IV77 575 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CNPY4Q8N129 248 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT16Q8N428 558 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC46Q96FV0 321 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC17Q96LX7 622 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MYD88Q99836 296 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 A0A087WZ62 844 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD19C9JJ37 291 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 THAP12O43422 761 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SLC5A1P13866 664 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CD19P15391 556 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.532e-10■■■□□ 14.6
PDE4D-215ENST00000506510 RBL1P28749 1068 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF543Q08ER8 600 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 HYIQ5T013 277 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SKAP1Q86WV1 359 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 POF1BQ8WVV4 589 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 A8MVJ9 347 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM232C9JQI7 657 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TP73O15350 636 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CA12O43570 354 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TSHRP16473 764 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 HTR7P34969 479 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 DDIT3P35638 169 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 COPAP53621 1224 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ELF2Q15723 593 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ETFDHQ16134 617 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ST3GAL2Q16842 350 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 LONRF1Q17RB8 773 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MORN5Q5VZ52 161 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS47A8MTI9 375 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ADRA1DP25100 572 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ATICP31939 592 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CCT5P48643 541 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PRIM2P49643 509 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CASP5P51878 434 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 KCNB1Q14721 858 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 RNF152Q8N8N0 203 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 VPS50Q96JG6 964 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FAM227BQ96M60 508 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TBCBQ99426 244 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 USP29Q9HBJ7 922 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 POLG2Q9UHN1 485 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ANP32CO43423 234 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 BCAR3O75815 825 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 AGR2O95994 175 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FGFR2P21802 821 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 STT3AP46977 705 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FHL3Q13643 280 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CLCA4Q14CN2 919 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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