RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NCAM1P13591 858 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 TYRP14679 529 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN1P35523 988 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC13P55735 322 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 UBXN1Q04323 297 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 C2orf27AQ580R0 203 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM110Q86TL2 294 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 MARK1Q9P0L2 795 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-210ENST00000505941 TULP3O75386 442 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 KDSRQ06136 332 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PDCLQ13371 301 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 GAB4Q2WGN9 574 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SYT13Q7L8C5 426 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PASD1Q8IV76 773 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK11Q8NG66 645 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SPAG5Q96R06 1193 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB23Q9ULC3 237 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0A0MRY4 1105 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 E5RJQ4 531 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 K7EQS6 105 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 GABBR2O75899 941 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 KLKB1P03952 638 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA6P31267 233 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CNR2P34972 360 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF445P59923 1031 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 NUGGCQ68CJ6 796 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 LONP2Q86WA8 852 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 NELL1Q92832 810 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINB11Q96P15 392 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR23AA6NEV1 266 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 LGALS16A8MUM7 142 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP11B1P15538 503 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC11A2P49281 568 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DGKGP49619 791 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF165P49910 485 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TBX4P57082 545 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TPM4P67936 248 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 BEND5Q7L4P6 421 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 C12orf40Q86WS4 652 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CPXM2Q8N436 756 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 USP33Q8TEY7 942 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DDI1Q8WTU0 396 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 BHMTQ93088 406 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 F8VZ95 297 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 K7ESF4 209 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNG3O60359 315 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 LATS1O95835 1130 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 GLI1P08151 1106 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TDGF1P13385 188 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 TIE1P35590 1138 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 FNTBP49356 437 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DMC1Q14565 340 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 NCAPHQ15003 741 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SYCP1Q15431 976 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 MPPE1Q53F39 396 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 SDE2Q6IQ49 451 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 HINFPQ9BQA5 517 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-210ENST00000505941 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms