RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 K7ERQ8 282 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PODXLO00592 558 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CXCL11O14625 94 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM20O43506 726 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OPN1LWP04000 364 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HMGCRP04035 888 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CSF2P04141 144 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TK1P04183 234 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ALPPP05187 535 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 ARP10275 920 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ALPPL2P10696 532 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CLUP10909 449 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 MTHFD2P13995 350 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 NME2P22392 152 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 CAPSQ13938 189 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DOC2BQ14184 412 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SEC23BQ15437 767 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM177Q53S58 311 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STYK1Q6J9G0 422 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 BORAQ6PGQ7 559 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LSMEM2Q8N112 164 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HIPK4Q8NE63 616 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PANK1Q8TE04 598 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 C18orf8Q96DM3 657 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 IQCDQ96DY2 449 aa7.57□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 WRNIP1Q96S55 665 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HAUS8Q9BT25 410 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 USP20Q9Y2K6 914 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.57□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 AQP12BA6NM10 295 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 E9PI62 339 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 E9PMD0 336 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DNM1LO00429 736 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFAB1O14561 156 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RASGRF2O14827 1237 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NPHS1O60500 1241 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LARGE1O95461 756 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PTAFRP25105 342 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CCR1P32246 355 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MTNR1BP49286 362 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FNTBP49356 437 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PRAMEP78395 509 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ST5P78524 1137 aa7.56□□□□□ -1.2
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