RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 TMEM225BP0DP42 221 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CFHR3Q02985 330 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 ZNF425Q6IV72 752 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 BEND5Q7L4P6 421 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 P3H2Q8IVL5 708 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 HIC2Q96JB3 615 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 ABCA6Q8N139 1617 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 H3BNC9 293 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 KIF3BO15066 747 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SPRY2O43597 315 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 BMP15O95972 392 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 DGKQP52824 942 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 HSPA2P54652 639 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 AFAP1Q8N556 730 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 FAM227BQ96M60 508 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 USP29Q9HBJ7 922 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 ASIC5Q9NY37 505 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-241ENST00000496183 PLA2R1Q13018 1463 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 PLXNC1O60486 1568 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 COQ9O75208 318 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MYL4P12829 197 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 TACR3P29371 465 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KCNAB1Q14722 419 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ETFDHQ16134 617 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MANEALQ5VSG8 457 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 RANBP10Q6VN20 620 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 APOL5Q9BWW9 433 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 C3P01024 1663 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ATP7AQ04656 1500 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 NCOA1Q15788 1441 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 AREL1O15033 823 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 MOSPD3O75425 235 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 BCAR3O75815 825 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 USP49Q70CQ1 688 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KRT73Q86Y46 540 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 PMM1Q92871 262 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 TIFAQ96CG3 184 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms