RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	STRN	O43815	780 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	APOE	P02649	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ASL	P04424	464 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BPGM	P07738	259 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFSF9	P41273	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP8	P22894	467 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIA1	P42261	906 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NME5	P56597	212 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZACN	Q401N2	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EXT2	Q93063	718 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HAUS8	Q9BT25	410 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LRCH4	O75427	683 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	DGAT1	O75907	488 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AMH	P03971	560 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TFPT	P0C1Z6	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	COX4I1	P13073	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CPA3	P15088	417 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LSAMP	Q13449	338 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GK3P	Q14409	553 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EMC2	Q15006	297 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MED7	O43513	233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TGDS	O95455	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RAP1GDS1	P52306	607 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM160B2	Q86V87	743 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	JADE3	Q92613	823 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TASP1	Q9H6P5	420 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TLE6	Q9H808	572 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SPAG6	O75602	509 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SDC4	P31431	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH15	P55291	814 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	WNT7B	P56706	349 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PID1	Q7Z2X4	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RCN3	Q96D15	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A088AWK7	358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292		H0YCG3	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ADCY6	O43306	1168 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	APOC2	P02655	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NR3C2	P08235	984 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ADRA2B	P18089	450 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	INHBC	P55103	352 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NAA20	P61599	178 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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