RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489783.1

SHOC2-206, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, humanhuman

TSL 2

Gene SHOC2, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2-206ENST00000489783 BEST1O76090 585 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 ACADMP11310 421 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 PRKCHP24723 683 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 CCT8P50990 548 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 MFAP3P55082 362 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 TNNC1P63316 161 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 CFHR1Q03591 330 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 Q6ZNB5 142 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.53■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 PCED1AQ9H1Q7 454 aa23.53■■□□□ 1.36
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SHOC2-206ENST00000489783 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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SHOC2-206ENST00000489783 SMOQ99835 787 aa23.52■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.52■■□□□ 1.36
SHOC2-206ENST00000489783 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.52■■□□□ 1.36
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SHOC2-206ENST00000489783 ATMQ13315 3056 aa23.52■■□□□ 1.36
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SHOC2-206ENST00000489783 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
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SHOC2-206ENST00000489783 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.49■■□□□ 1.35
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SHOC2-206ENST00000489783 KIF3AQ9Y496 699 aa23.49■■□□□ 1.35
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SHOC2-206ENST00000489783 H3BQV1 296 aa23.48■■□□□ 1.35
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SHOC2-206ENST00000489783 COL6A6A6NMZ7 2263 aa23.47■■□□□ 1.35
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SHOC2-206ENST00000489783 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SHOC2-206ENST00000489783 BMP15O95972 392 aa23.47■■□□□ 1.35
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