RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-241	ENST00000487169	HOXC6	P09630	235 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CNGA3	Q16281	694 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MEA1	Q16626	185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	EME1	Q96AY2	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CDT1	Q9H211	546 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TSPAN3	O60637	253 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TRIM16	O95361	564 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CRTAM	O95727	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	EPB42	P16452	691 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KLRC2	P26717	231 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KCNK10	P57789	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21	5e-8	■■□□□ 12.2
HDLBP-241	ENST00000487169	TPH1	P17752	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MGAT5	Q09328	741 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CAPS	Q13938	189 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ADRB2	P07550	413 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MLH1	P40692	756 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ELK3	P41970	407 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SP3	Q02447	781 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TRIP10	Q15642	601 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CCDC130	P13994	396 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CYTH1	Q15438	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PRKCI	P41743	596 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	FUT2	Q10981	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GLP2R	O95838	553 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NFIC	P08651	508 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SERPINB8	P50452	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CNGA2	Q16280	664 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms