RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-209ENST00000484097 DEC1Q9P2X7 70 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-209ENST00000484097 E5RJQ4 531 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 KLKB1P03952 638 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP11B1P15538 503 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 KLK7P49862 253 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PDCLQ13371 301 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 GANQ9H2C0 597 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 F8VZ95 297 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 KAT7O95251 611 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CYBBP04839 570 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP1A3P13637 1013 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TPM4P67936 248 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 C12orf40Q86WS4 652 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNCQ9H7C4 482 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 R4GN57 208 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNA1HO95180 2353 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PROB1E7EW31 1015 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TULP3O75386 442 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TYRP14679 529 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 STAT1P42224 750 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 GRIA2P42262 883 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MRE11P49959 708 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC13P55735 322 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 KDSRQ06136 332 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TAF3Q5VWG9 929 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ACDQ96AP0 544 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CPXM1Q96SM3 734 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MARK1Q9P0L2 795 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EQS6 105 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 GFPT2O94808 682 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SOX5P35711 763 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFRSF4P43489 277 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TBX4P57082 545 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf27AQ580R0 203 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 BEND5Q7L4P6 421 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 BHMTQ93088 406 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINB11Q96P15 392 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0A0MRY4 1105 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 FYNP06241 537 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CPXM2Q8N436 756 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 PLK2Q9NYY3 685 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 EPHB6O15197 1021 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNG3O60359 315 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 CAVIN2O95810 425 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 LATS1O95835 1130 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 GLI1P08151 1106 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC11A2P49281 568 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-209ENST00000484097 RING1Q06587 406 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms