RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 GFPT2O94808 682 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SOX5P35711 763 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 MESP2Q0VG99 397 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TAF3Q5VWG9 929 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 BEND5Q7L4P6 421 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 LUZP1Q86V48 1076 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 DENND1CQ8IV53 801 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NOX5Q96PH1 765 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 MARK1Q9P0L2 795 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 RNF40O75150 1001 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NCAM1P13591 858 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 STAT1P42224 750 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CCR3P51677 355 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SATB1Q01826 763 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TAF5Q15542 800 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ANO4Q32M45 955 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FBXO43Q4G163 708 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TSSK4Q6SA08 328 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NAT16Q8N8M0 369 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 P2RY11Q96G91 374 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SPAG5Q96R06 1193 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PNKPQ96T60 521 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A0MRY4 1105 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTH6 734 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 K7EQS6 105 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CAVIN2O95810 425 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ERBB2P04626 1255 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TDGF1P13385 188 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CXCL12P48061 93 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 BBS2Q9BXC9 721 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CEP83Q9Y592 693 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ANTXRLA6NF34 631 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TULP3O75386 442 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 KAT7O95251 611 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-27P01718 113 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 MMEP08473 750 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CHRNB2P17787 502 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CHKAP35790 457 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NBL1P41271 181 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF677Q86XU0 584 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NELL1Q92832 810 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TRIM24O15164 1050 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CACNG3O60359 315 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 GLI1P08151 1106 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TYRP14679 529 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 GRIA2P42262 883 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 GABRB2P47870 512 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TBX4P57082 545 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SNX16P57768 344 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CDR2Q01850 454 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 KDSRQ06136 332 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FYB2Q5VWT5 728 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CPXM2Q8N436 756 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQC6 194 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 CAPN9O14815 690 aa21.83■■□□□ 1.09
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