RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 HHLA1C9JL84 531 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TLR5O60602 858 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CBFA2T3O75081 653 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 PHACTR2O75167 634 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFS2O75306 463 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SYPP08247 313 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ATICP31939 592 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TUBP50607 506 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K7CLP57077 242 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ASIC1P78348 528 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 DLG4P78352 724 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 EHHADHQ08426 723 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 KCNH2Q12809 1159 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SDE2Q6IQ49 451 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MDM1Q8TC05 714 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 BHMTQ93088 406 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 DHX58Q96C10 678 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO10Q9UK96 956 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MTMR6Q9Y217 621 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PQH9 124 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CACNG3O60359 315 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 KLKB1P03952 638 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CD6P30203 668 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 DGKGP49619 791 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 NDST1P52848 882 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 VAC14Q08AM6 782 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 GRIK2Q13002 908 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SLC14A1Q13336 389 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 BIRC3Q13489 604 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 NCOA4Q13772 614 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 GEN1Q17RS7 908 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FUT11Q495W5 492 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SHC4Q6S5L8 630 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SCD5Q86SK9 330 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 NAXDQ8IW45 347 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TWNKQ96RR1 684 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 GPR174Q9BXC1 333 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 NACA2Q9H009 215 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TNMDQ9H2S6 317 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.988e-25■■■■■ 264
CTPS1-208ENST00000479480 KRT82Q9NSB4 513 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 MARK1Q9P0L2 795 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-208ENST00000479480 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-208ENST00000479480 CYP26A1O43174 497 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-208ENST00000479480 EXOC3O60645 756 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-208ENST00000479480 S1PR4O95977 384 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-208ENST00000479480 RARGP13631 454 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms