RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNAB1Q14722 419 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TBR1Q16650 682 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKS6Q68DC2 871 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 PDXDC1Q6P996 788 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 DNERQ8NFT8 737 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 HVCN1Q96D96 273 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 RTKNQ9BST9 563 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 DKK4Q9UBT3 224 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 AASSQ9UDR5 926 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ATRXP46100 2492 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 MROH6A6NGR9 719 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 H0Y3Z8 333 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 HAUS5O94927 633 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 AGFG2O95081 481 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ANXA1P04083 346 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKCBP05771 671 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 RXRAP19793 462 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 GZMKP49863 264 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 POLE2P56282 527 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 DCAF7P61962 342 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 MXRA7P84157 204 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NUCB1Q02818 461 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 PTH1RQ03431 593 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE3AQ05086 875 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC12A1Q13621 1099 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 AGBL4Q5VU57 503 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA1Q5VX52 437 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 RRAGAQ7L523 313 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 UCMAQ8WVF2 138 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 C20orf173Q96LM9 149 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 GPHA2Q96T91 129 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10A2Q9H208 303 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NCDNQ9UBB6 729 aa6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PPH5 198 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf118A6NHY6 69 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NRP1O14786 923 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NTSR2O95665 410 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 GLP2RO95838 553 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TK1P04183 234 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 TPH1P17752 444 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 KLRK1P26718 216 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 MST1P26927 711 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CSF2RBP32927 897 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 BCAT1P54687 386 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTR2P61160 394 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 RAP2BP61225 183 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 HGFACQ04756 655 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CHRNDQ07001 517 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SCAPQ12770 1279 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT40Q6A162 431 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZUG5 572 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT73Q86Y46 540 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 OR8H2Q8N162 312 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
STRADBP1-201ENST00000478954 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms