RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.59□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.59□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.59□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.59□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ANKRD62A6NC57 917 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SHISA7A6NL88 538 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ZNF185O15231 689 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HUS1O60921 280 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PRAMEF12O95522 483 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PDGFRBP09619 1106 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SP9P0CG40 484 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GZMAP12544 262 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PSMC3P17980 439 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CYP2F1P24903 491 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NBL1P41271 181 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 EPHA5P54756 1037 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MFAP3P55082 362 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 RBP5P82980 135 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TSPY1Q01534 308 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PFKPQ01813 784 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PRKCQQ04759 706 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DDR2Q16832 855 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CBWD6Q4V339 395 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PEX26Q7Z412 305 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 IFT20Q8IY31 132 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 YAF2Q8IY57 180 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CXorf38Q8TB03 319 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 COG1Q8WTW3 980 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 STIM2Q9P246 746 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 AMFRQ9UKV5 643 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DSEQ9UL01 958 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MAFFQ9ULX9 164 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ZNF233A6NK53 670 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TNNC2P02585 160 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TRIM49P0CI25 452 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TRIM49CP0CI26 452 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TNNI1P19237 187 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LMO2P25791 158 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HOXC13P31276 330 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 APBA1Q02410 837 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TNK2Q07912 1038 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 C2orf54Q08AI8 447 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 VEPH1Q14D04 833 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 TXNDC8Q6A555 127 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ITIH5Q86UX2 942 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 LMO3Q8TAP4 145 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 PSMG2Q969U7 264 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 EXOC4Q96A65 974 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 HPDLQ96IR7 371 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 NT5C1BQ96P26 610 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 AGPAT1Q99943 283 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SYT11Q9BT88 431 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 BCO2Q9BYV7 579 aa6.58□□□□□ -1.36
MITF-215ENST00000478490 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 67.3
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