RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G6	O60733	806 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CYTIP	O60759	359 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PHACTR2	O75167	634 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ULK1	O75385	1050 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CTAG2	O75638	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PFKM	P08237	780 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AR	P10275	920 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CHN1	P15882	459 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FUT4	P22083	530 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GLRA2	P23416	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AKAP5	P24588	427 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LSP1	P33241	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RFC2	P35250	354 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM23	P36406	574 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MAGEA4	P43358	317 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF445	P59923	1031 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UBE3A	Q05086	875 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT2	Q10471	571 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CRYM	Q14894	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SNCB	Q16143	134 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DGKD	Q16760	1214 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RTP2	Q5QGT7	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MON1A	Q86VX9	555 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SLC43A2	Q8N370	569 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BBS5	Q8N3I7	341 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPT2	Q8TD30	523 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CALML6	Q8TD86	181 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	OPTN	Q96CV9	577 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MASTL	Q96GX5	879 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MSANTD3	Q96H12	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	WNK4	Q96J92	1243 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PLIN2	Q99541	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SH2D4A	Q9H788	454 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C8orf4	Q9NR00	106 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	INTS13	Q9NVM9	706 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PSAT1	Q9Y617	370 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PPC4	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC151	A5D8V7	595 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398		H3BM21	787 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PEX1	O43933	1283 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CBFA2T3	O75081	653 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJB6	O75190	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PPM1B	O75688	479 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GDF11	O95390	407 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PIGN	O95427	931 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	IL1A	P01583	271 aa		3.37	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms