RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 SLC26A9Q7LBE3 791 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYNE4-204ENST00000465425 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.96■□□□□ 0.63
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SYNE4-204ENST00000465425 GABBR2O75899 941 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 CSH2P0DML3 217 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 MROH9Q5TGP6 573 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 E2F7Q96AV8 911 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 HES2Q9Y543 173 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 NME7Q9Y5B8 376 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC130P13994 396 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 MPP5Q8N3R9 675 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.95■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.95■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 SERPINB9P50453 376 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 SNAPC2Q13487 334 aa18.94■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 TAF11Q15544 211 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CHI3L2Q15782 390 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF534Q76KX8 674 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFAF2Q8N183 169 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD52Q8NB46 1076 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 C7orf26Q96N11 449 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 MKS1Q9NXB0 559 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 FAM159BA6NKW6 160 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 GNAZP19086 355 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 BST1Q10588 318 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CASC4Q6P4E1 433 aa18.94■□□□□ 0.62
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SYNE4-204ENST00000465425 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 DTLQ9NZJ0 730 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 SCN1AP35498 2009 aa18.94■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 KAT6AQ92794 2004 aa18.93■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.93■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA5AQ13591 1074 aa18.93■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 KRT72Q14CN4 511 aa18.93■□□□□ 0.62
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.93■□□□□ 0.62
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