RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 GALK1P51570 392 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 CDK17Q00537 523 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 ARID5AQ03989 594 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 E2F5Q15329 346 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 F5P12259 2224 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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IMP4-209ENST00000462357 SLC2A3P11169 496 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 SLC6A3Q01959 620 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 RING1Q06587 406 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 NNTQ13423 1086 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 FIGNQ5HY92 759 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.47■■□□□ 1.03
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IMP4-209ENST00000462357 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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IMP4-209ENST00000462357 CPXM1Q96SM3 734 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 PNKPQ96T60 521 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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IMP4-209ENST00000462357 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 APODP05090 189 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 CHRNB1P11230 501 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 SCNN1AP37088 669 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 CCR3P51677 355 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 TBX4P57082 545 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 DENND1CQ8IV53 801 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 AZIN2Q96A70 460 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 BBS2Q9BXC9 721 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 CHRDQ9H2X0 955 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-209ENST00000462357 OBSL1O75147 1896 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 EPHB6O15197 1021 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 MMEP08473 750 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 DCAF6Q58WW2 860 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 RNF34Q969K3 372 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.45■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 PATJQ8NI35 1801 aa21.44■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 TPM1P09493 284 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DESP17661 470 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TNFAIP3P21580 790 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 GRIA2P42262 883 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 NRLP54845 237 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CCINQ13939 588 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ASIC2Q16515 512 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MPPE1Q53F39 396 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ADGRF1Q5T601 910 aa21.44■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TMEM25Q86YD3 366 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 AGPAT1Q99943 283 aa21.44■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.43■■□□□ 1.02
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IMP4-209ENST00000462357 F9P00740 461 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 NOS2P35228 1153 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CXCL12P48061 93 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ANGPT1Q15389 498 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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