RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 WWP1Q9H0M0 922 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GBA3Q9H227 469 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SFI1A8K8P3 1242 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H6K3 240 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SGPL1O95470 568 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY3P0CV98 308 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY8P0CW00 308 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 VAMP1P23763 118 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRC2P26717 231 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP107P57740 925 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GPX6P59796 221 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMC6P62333 389 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL7Q01449 175 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 COG2Q14746 738 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2SQ16763 222 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EFHC2Q5JST6 749 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRB2Q8N423 598 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ALLCQ8N6M5 410 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RDH13Q8NBN7 331 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EBF4Q9BQW3 602 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf21Q9H246 121 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH22Q9UJ99 828 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB26Q9ULW5 256 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 I3L4J1 428 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EML1O00423 815 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MED24O75448 989 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND3P03897 115 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EPB42P16452 691 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ADSSP30520 456 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2J2P51589 502 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC12A3P55017 1021 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS15P98073 1019 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKL1Q00532 357 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GPS1Q13098 491 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK2BQ13554 666 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX6Q13608 980 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPUQ71F23 418 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F7Q96AV8 911 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 UROC1Q96N76 676 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFB1I1O43294 461 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 AGR2O95994 175 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RCVRNP35243 200 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A1P43005 524 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV4P43268 484 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf59P57076 290 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC4P59998 168 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 BST1Q10588 318 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIK5Q16478 980 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNG2Q16589 344 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CHSY1Q86X52 802 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MZB1Q8WU39 189 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPH1Q92598 858 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT5Q92993 513 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPKCQ96DU7 683 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.67□□□□□ -1.02
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