RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 USP3Q9Y6I4 520 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 GOT1P17174 413 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PGFP49763 221 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 RTP2Q5QGT7 225 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAF2Q96CS3 445 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 AAASQ9NRG9 546 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.18e-8■■■■■ 126.3
PTPRF-207ENST00000436724 I6L893 689 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 TNFRSF10BO14763 440 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 APOL1O14791 398 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 MCF2LO15068 1137 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CLTBP09497 229 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 GPS1Q13098 491 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 IKBKEQ14164 716 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 NOMO1Q15155 1222 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DDR2Q16832 855 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DDIT4Q9NX09 232 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FGFR3P22607 806 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PMS2P54278 862 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 LRRC43Q8N309 656 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ARMC5Q96C12 935 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PATJQ8NI35 1801 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 H0YGN5 161 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 NFS1Q9Y697 457 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SOAT2O75908 522 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 AMPD1P23109 780 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 IRAK1P51617 712 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF280DQ6N043 979 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 GPR152Q8TDT2 470 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 IRGQQ8WZA9 623 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PTPRF-207ENST00000436724 GBE1Q04446 702 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 MTMR3Q13615 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SRLQ86TD4 932 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 VSIG1Q86XK7 387 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DGKIO75912 1065 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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PTPRF-207ENST00000436724 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAM72CH0Y354 149 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 H7C0C1 242 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CREB3O43889 395 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CPB1P15086 417 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CSF2RAP15509 400 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 TGM2P21980 687 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ATP5OP48047 213 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRF-207ENST00000436724 TAC4Q86UU9 113 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAM72BQ86X60 149 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 NETO2Q8NC67 525 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ADRA1BP35368 520 aa21.89■■□□□ 1.1
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