RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 ALDH1A2O94788 518 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBED1O96006 694 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CD19P15391 556 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 WASP42768 502 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 COG7P83436 770 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP7D1Q3KQU3 841 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 MARCH2Q9P0N8 246 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP205Q92621 2012 aa29.28■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CAVIN2O95810 425 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 PENKP01210 267 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CALCAP01258 141 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 VDRP11473 427 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 BST2Q10589 180 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 FYB2Q5VWT5 728 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 C11orf74Q86VG3 221 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGAP18Q8N392 663 aa29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TRIOBP-209ENST00000428075 GABRG2P18507 467 aa29.26■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 NTSR1P30989 418 aa29.26■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PPP1R2P41236 205 aa29.26■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ADIGQ0VDE8 80 aa29.26■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 STPG1Q5TH74 334 aa29.26■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 GON4LQ3T8J9 2241 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 DGKGP49619 791 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 STX17P56962 302 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC8A3P57103 927 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PPM1JQ5JR12 505 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1211LQ6NV74 962 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM270Q6UE05 265 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 DENND1CQ8IV53 801 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM59Q8IWR1 403 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KCTD13Q8WZ19 329 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 NT5C1BQ96P26 610 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 HESX1Q9UBX0 185 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF510Q9Y2H8 683 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa29.25■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC12A8A0AV02 714 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 YJEFN3A6XGL0 299 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 E7ENQ6 273 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PAEPP09466 180 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 HOXB2P14652 356 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 NUDT18Q6ZVK8 323 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 DCLK3Q9C098 648 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC4Q9HBW1 653 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CLEC4EQ9ULY5 219 aa29.24■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PATE3B3GLJ2 98 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM217AQ8IXS0 508 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PPM1KQ8N3J5 372 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC35F5Q8WV83 523 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ERLEC1Q96DZ1 483 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 GABRG3Q99928 467 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa29.23■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 BICDL2A1A5D9 508 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 P4HA2O15460 535 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SETSIPP0DME0 302 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 MARSP56192 900 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 BSPRYQ5W0U4 402 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PMF1Q6P1K2 205 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 RRAGAQ7L523 313 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEFF1Q8IYR6 380 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CHPFQ8IZ52 775 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 SCML4Q8N228 414 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 EDEM1Q92611 657 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KREMEN1Q96MU8 473 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 STRIP2Q9ULQ0 834 aa29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 TPRP12270 2363 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 LNP1A1A4G5 178 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 WASH3PC4AMC7 463 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CHKAP35790 457 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PTGER3P43115 390 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF132P52740 706 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 MFAP3P55082 362 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNH2Q12809 1159 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PAK1Q13153 545 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CNGA2Q16280 664 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 GEN1Q17RS7 908 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP2U1Q7Z449 544 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 PGBD3Q8N328 593 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 CPXM2Q8N436 756 aa29.21■■■□□ 2.27
TRIOBP-209ENST00000428075 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms