RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TIMM44O43615 452 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TNFAIP8O95379 198 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ACADSBP45954 432 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CCNG2Q16589 344 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00523Q86TU6 105 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAR2Q96K12 515 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SLC26A4O43511 780 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CLOCKO15516 846 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VAC14Q08AM6 782 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GDF3Q9NR23 364 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA2Q9UM82 520 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 UBDO15205 165 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MAGEB2O15479 319 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FGFR3P22607 806 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FASP25445 335 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GRIK5Q16478 980 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VTA1Q9NP79 307 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PROSCO94903 275 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 IL18RAPO95256 599 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NPTXRO95502 500 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ELK3P41970 407 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CEP41Q9BYV8 373 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DDIT4Q9NX09 232 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 UBP1Q9NZI7 540 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RAP1GAPP47736 663 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GIT2Q14161 759 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 UTS2BQ765I0 119 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ACTL9Q8TC94 416 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CHKBQ9Y259 395 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MAP2K7O14733 419 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 INPP4BO15327 924 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ANXA9O76027 345 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PSMG1O95456 288 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH1A1P00352 501 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 EPB42P16452 691 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GSTT1P30711 240 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CDC16Q13042 620 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CREG2Q8IUH2 290 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CAPN10Q9HC96 672 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PIPSLA2A3N6 862 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PTGES3LE9PB15 166 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MTSS1O43312 755 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAM20BO75063 409 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MLNP12872 115 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DCLK3Q9C098 648 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRT84Q9NSB2 600 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CXCL11O14625 94 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ALOX12P18054 663 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ADRA1DP25100 572 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KCNJ2P63252 427 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 HPCAP84074 193 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VEPH1Q14D04 833 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FIG4Q92562 907 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ACAP1Q15027 740 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NRF1Q16656 503 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 EXD1Q8NHP7 514 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PHF21BQ96EK2 531 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CDRT15Q96T59 188 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms